マルチオミックス受託解析サービス ID: J01417

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プロテインプロファイリングとRNAプロファイリングを同一検体から実現

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サービスについて

概要

ひとつのサンプルからRNAとタンパク質を抽出し、トランスクリプトーム解析及びプロテオーム解析を同時に実施します。プロテオーム解析の分析深度が従来よりも圧倒的に高まったことで観測対象となる分子が大幅に増加し、トランスクリプトーム解析データとの遺伝子数の差が小さくなりました。より包括的なデータが得られ、従来の技術では見いだせなかった新しい発見が期待できます。
サンプル（細胞、組織の場合）はフェノールグアニジン系の試薬、もしくはRNA保護試薬に浸した状態で送付するだけで良く、RNA・タンパク質抽出から解析までかずさDNA研究所にて一貫して行います。（fig.1）

fig.1 サービスイメージ

【実験例】

試験化合物の添加の有無による細胞内のトランスクリプトーム・プロテオームへの影響比較
組織中の正常部位と病変部位の比較

サービス内容

使用機器
トランスクリプトーム解析：NextSeq 500［イルミナ社］
プロテオーム解析：Orbitrap Exploris 480 [Thermo Fisher Scientific社], Q-Exactive HF-X [Thermo Fisher Scientific社]
プロテオーム解析はタンパク質配列が解析されている生物種が対象となります。
RNA-Seqとプロテオーム解析で観測されたmRNAとタンパク質をコードする遺伝子の重複（fig.2）
RNA-SeqとOrbitrap Exploris 480導入以前のデータ依存型分析法（DDA）によるプロテオーム解析（左図）とRNA-Seqと本受託サービスのOrbitrap Exploris 480を用いた高深度DIAプロテオーム解析（右図）との比較を示す。サンプルはHEK293 細胞を用い、RNA-Seqとプロテオーム解析のそれぞれの解析で用いたデータベースに共通して存在した遺伝子のみを対象とした。以前のプロテオーム解析ではRNA-Seqで観測できる遺伝子数との差が大きかったが、本受託サービスの高深度DIAプロテオーム解析ではその点が大きく改善され、マルチオミクス解析を行う上で対象となる分子が大幅に増加した。

fig.2 RNA-Seqとプロテオーム解析で観測されたmRNAとタンパク質をコードする遺伝子の重複

解析メニュー

トランスクリプトーム解析、プロテオーム解析、メタボローム解析メニューからご希望の項目を選択し、組み合わせることができます。ゲノム解析をご希望の場合はお問合せください。
＊取得データ量は目安の数値であり、それらのデータ量を保証するものではありません。

作業内容：
RNA/タンパク質/代謝物抽出（＊1）＋ご希望の解析メニュー＋簡易データ解析（＊2）
＊1 サンプルが凍結培養細胞、凍結組織の場合。その他のサンプルはご相談ください。
＊2 ヒト、マウス由来サンプルの場合。

トランスクリプトーム解析
発現解析
	・3’RNA Seq
	取得データ目安：100万リード	納期：8週間	価格（1サンプルあたり）：お問い合わせ

プロテオーム解析　下記から選択できます。
プロテオーム解析	・標準DIAプロテオーム解析によるタンパク質発現・相対定量解析：LC-MS/MS(DIA)
	取得データ目安：7,000〜8,500タンパク質	納期：4週間	価格（1サンプルあたり）： ¥ 198,000～（税抜）
	・高深度DIAプロテオーム解析によるタンパク質発現・相対定量解析：　GPF+LC-MS/MS(ライブラリ作製用)LC-MS/MS(DIA)
	取得データ目安：8,500〜1,000タンパク質	納期：4週間	価格（1サンプルあたり）： ¥ 294,000～（税抜）
リン酸化プロテオーム解析	・DIAリン酸化プロテオーム解析によるタンパク質発現・相対定量解析：　LC-MS/MS (DDA, ライブラリ作製用) LC-MS/MS (DIA, 相対定量解析用)
	取得データ目安：8,000〜12,000リン酸化ペプチド断片	納期：4週間	価格（1サンプルあたり）： ¥ 291,000～（税抜）
	・高深度DIAリン酸化プロテオーム解析による比較定量解析： LC-MS/MS(DIA, 相対定量解析用)
	取得データ目安：12,000〜20,000リン酸化ペプチド断片	納期：4週間	価格（1サンプルあたり）： ¥ 379,000～（税抜）

メニュー内容についてはプロテオーム解析のページをご覧ください。

メタボローム解析　下記から選択できます。
脂溶性代謝物解析
網羅的代謝物の同定・相対定量解析	・高深度なノンバイアス（ノンターゲット）スクリーニングによる高網羅的な脂質代謝物の同定・相対定量解析
網羅的代謝物の同定・相対定量解析	取得データ目安：独自の先端的なin-house同定ソフトウェアや分離分析技術による脂質の網羅的なスクリーニング（500〜1,000分子程度を検出想定）【対象】遊離脂肪酸（中鎖～極長鎖型）、リゾリン脂質類、リン脂質類、スフィンゴイド類（S1Pを含む）、セラミド類、糖セラミド類（ガングリオシドなど）、グリセロ脂質類（中性脂質など）、グリセロ糖脂質類（MGDGなど）、ステロールエステル類（コレステロールエステルなど）、脂肪酸代謝物（アシルカルニチン・CoAなど）、リポアミノ類（アナンダミドなど）等	納期：4～8週間	価格（1サンプルあたり）： ¥ 225,000～（税抜）
標的代謝物の相対定量解析	・フォーカシング（ターゲット）解析：遊離脂肪酸の相対定量解析
標的代謝物の相対定量解析	取得データ目安：C2～C24程度の遊離脂肪酸の高分離分析（20～40分子程度を検出想定）【対象】飽和脂肪酸、不飽和脂肪酸	納期：4～8週間	価格（1サンプルあたり）： ¥ 180,000～（税抜）
水溶性代謝物解析
標的代謝物の相対定量解析	・”ワイド”フォーカシング解析：包括的な親水性代謝物の相対定量解析
標的代謝物の相対定量解析	取得データ目安：ω-3とω-6系脂肪酸（C18,20,22）由来の酸化代謝物の一斉分析（100～200分子程度を検出想定）【対象】リノール酸由来、リノレン酸由来、アラキドン酸由来、EPA由来、DHA由来など	納期：4～8週間	価格（1サンプルあたり）： ¥ 225,000～（税抜）

メニュー内容についてはメタボローム解析のページをご覧ください。

必要サンプル量（目安）

<トランスクリプトーム解析>　total RNA：2µg以上（40ng / µL以上）
<プロテオーム解析>　お問い合わせ
<メタボローム解析>　細胞1×10⁷以上、組織50mg以上、血清 / 血漿 1µL以上、尿200µL以上
　　　　　　　　　　メニュー、サンプル種により必要サンプル量は増減します。お問合せの上ご確認ください。

納品物

作業報告書、fastqファイル、MSデータ、MS解析データ、最終的な解析結果（＊）を記載したファイルの入ったDVD またはUSB メモリスティック
＊取得データ量は目安の数値であり、それらのデータ量を保証するものではありません。

ご注文に関して

お問い合わせフォームよりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス内容	価格（税抜）	納期
マルチオミックス受託解析サービス	上記価格をご確認ください	ご希望の解析メニューのうち最も納期が長いもの＋1週間程度

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